Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF38BQ5VTL8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF38BQ5VTL8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms