Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms