Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY2Q49AN0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms