Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms