Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP27-1Q3LI81 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP27-1Q3LI81 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP27-1Q3LI81 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP27-1Q3LI81 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP27-1Q3LI81 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP27-1Q3LI81 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP27-1Q3LI81 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP27-1Q3LI81 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP27-1Q3LI81 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP27-1Q3LI81 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP27-1Q3LI81 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP27-1Q3LI81 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP27-1Q3LI81 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms