Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEACAM16Q2WEN9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms