Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC96Q2M329 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC96Q2M329 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms