Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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COL24A1Q17RW2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
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