Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RTL8BQ17RB0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RTL8BQ17RB0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RTL8BQ17RB0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RTL8BQ17RB0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RTL8BQ17RB0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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