Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPROQ16827 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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