Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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SGCAQ16586 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SGCAQ16586 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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