Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ZFHX3Q15911 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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ZFHX3Q15911 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ZFHX3Q15911 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ZFHX3Q15911 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ZFHX3Q15911 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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