Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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