Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRADDQ15628 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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