Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms