Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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