Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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BRD3Q15059 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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BRD3Q15059 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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BRD3Q15059 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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BRD3Q15059 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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BRD3Q15059 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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