Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HDM1Q15032 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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