Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHPRHQ149N8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
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