Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF235Q14590 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms