Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VGLL4Q14135 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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