Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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COL4A6Q14031 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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COL4A6Q14031 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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COL4A6Q14031 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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COL4A6Q14031 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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COL4A6Q14031 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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COL4A6Q14031 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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COL4A6Q14031 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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COL4A6Q14031 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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