Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALCAMQ13740 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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