Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
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NAE1Q13564 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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NAE1Q13564 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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NAE1Q13564 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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NAE1Q13564 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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NAE1Q13564 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms