Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKD2Q13563 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKD2Q13563 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
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