Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms