Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLAMF1Q13291 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
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