Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms