Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RESTQ13127 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RESTQ13127 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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RESTQ13127 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
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RESTQ13127 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RESTQ13127 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RESTQ13127 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RESTQ13127 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RESTQ13127 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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RESTQ13127 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RESTQ13127 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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RESTQ13127 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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RESTQ13127 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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RESTQ13127 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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RESTQ13127 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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RESTQ13127 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RESTQ13127 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RESTQ13127 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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RESTQ13127 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RESTQ13127 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RESTQ13127 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RESTQ13127 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RESTQ13127 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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