Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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