Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PTPRJQ12913 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
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PTPRJQ12913 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PTPRJQ12913 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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PTPRJQ12913 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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PTPRJQ12913 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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PTPRJQ12913 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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PTPRJQ12913 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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PTPRJQ12913 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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PTPRJQ12913 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
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