Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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BPTFQ12830 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BPTFQ12830 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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