Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMARCB1Q12824 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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