Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms