Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GOLGA3Q08378 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms