Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD51Q06609 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms