Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME1Q06323 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms