Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DEUP1Q05D60 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms