Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CD164Q04900 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CD164Q04900 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CD164Q04900 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms