Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF85Q03923 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms