Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms