Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK16Q00536 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms