Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms