Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO4P98177 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms