Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VBP1P61758 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VBP1P61758 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VBP1P61758 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VBP1P61758 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VBP1P61758 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VBP1P61758 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VBP1P61758 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VBP1P61758 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VBP1P61758 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VBP1P61758 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VBP1P61758 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VBP1P61758 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VBP1P61758 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VBP1P61758 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VBP1P61758 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VBP1P61758 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VBP1P61758 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VBP1P61758 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VBP1P61758 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VBP1P61758 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VBP1P61758 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VBP1P61758 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VBP1P61758 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VBP1P61758 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VBP1P61758 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VBP1P61758 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms