Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BACE1P56817 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BACE1P56817 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BACE1P56817 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BACE1P56817 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BACE1P56817 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BACE1P56817 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BACE1P56817 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BACE1P56817 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BACE1P56817 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BACE1P56817 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BACE1P56817 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BACE1P56817 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BACE1P56817 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BACE1P56817 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BACE1P56817 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BACE1P56817 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BACE1P56817 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BACE1P56817 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BACE1P56817 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BACE1P56817 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BACE1P56817 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BACE1P56817 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BACE1P56817 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BACE1P56817 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BACE1P56817 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BACE1P56817 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BACE1P56817 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BACE1P56817 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BACE1P56817 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BACE1P56817 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BACE1P56817 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BACE1P56817 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BACE1P56817 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BACE1P56817 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BACE1P56817 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BACE1P56817 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BACE1P56817 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BACE1P56817 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BACE1P56817 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BACE1P56817 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BACE1P56817 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BACE1P56817 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BACE1P56817 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BACE1P56817 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms