Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP6P55212 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP6P55212 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP6P55212 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASP6P55212 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP6P55212 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP6P55212 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP6P55212 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP6P55212 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP6P55212 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP6P55212 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP6P55212 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP6P55212 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP6P55212 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP6P55212 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP6P55212 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP6P55212 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP6P55212 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP6P55212 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP6P55212 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP6P55212 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP6P55212 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP6P55212 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP6P55212 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP6P55212 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP6P55212 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP6P55212 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP6P55212 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP6P55212 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP6P55212 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP6P55212 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP6P55212 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP6P55212 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP6P55212 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP6P55212 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP6P55212 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP6P55212 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP6P55212 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP6P55212 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms