Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms