Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX2P50458 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX2P50458 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX2P50458 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX2P50458 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX2P50458 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX2P50458 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX2P50458 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX2P50458 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX2P50458 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX2P50458 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX2P50458 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX2P50458 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX2P50458 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX2P50458 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX2P50458 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LHX2P50458 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LHX2P50458 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LHX2P50458 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX2P50458 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms