Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CENPAP49450 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CENPAP49450 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CENPAP49450 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CENPAP49450 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPAP49450 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPAP49450 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPAP49450 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPAP49450 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPAP49450 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPAP49450 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPAP49450 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPAP49450 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPAP49450 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPAP49450 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPAP49450 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPAP49450 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPAP49450 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPAP49450 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPAP49450 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPAP49450 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPAP49450 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPAP49450 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPAP49450 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPAP49450 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPAP49450 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPAP49450 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPAP49450 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPAP49450 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPAP49450 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms